La Amazonia peruana es una de las áreas con mayor biodiversidad y endemismos del planeta, así como la región biogeográfica peruana con menor población humana. No obstante tener la menor densidad poblacional del país, es a su vez la más diversa antropológicamente. La mayor parte de etnias del país se asientan en ella y son habladas allí el grueso de las lenguas autóctonas del Perú.
Es tan grande la variedad de especies que se estima que la mayor parte de ellas sigue sin ser descubierta y menos estudiadas adecuadamente.
Perú es considerado el segundo país en número de especies de aves, despues de Colombia. Se han registrado 1825 especies (que podría aumentar a 1840 en función de algunos cambios taxonómicos) pertenecientes a 23 órdenes y 89 familias, con al menos 105 especies endémicas al país.
Y es el tercero en cuanto a mamíferos, de los que 44% y 63% respectivamente habita en la Amazonia peruana.